Может ли организация самостоятельно разработать и закрепить в своей учетной политике порядок учета потерь от простоев?
Да, может.
Поскольку порядок учета потерь от простоев нормативно не определен, рекомендуем разработать его самостоятельно и закрепить в учетной политике (п. п. 4, 7 ПБУ 1/2008). Например, можно предусмотреть, что начисление оплаты работнику за время простоя, вызванного внутренними причинами, будет отражаться по дебету счета 90 "Продажи", субсчет 90-2 "Себестоимость продаж", и кредиту счета 70 "Расчеты с персоналом по оплате труда".